I Danmark dyrker man mange forskellige økologiske afgrøder, herunder forskellige typer af korn. Økologisk dyrkning stiller særlige krav til, hvordan landmanden dyrker jorden.
Omkring en tredjedel af den mælk der drikkes i Danmark er økologisk. Økologiske køer skal have mulighed for et liv, der er i overensstemmelse med deres naturlige adfærd og behov, hvilket indebærer at de skal på græs om sommeren.
I den økologiske svineproduktion er dyrevelfærd i centrum. Dyrene skal have mulighed for at udøve deres naturlige adfærd. Derfor tilstræber man, at opdrætsmetoder og staldforhold imødeser svinenes fysiologiske og adfærdsmæssige behov.
Danmark har en betydelig produktion af økologiske æg. Økologiske høner har god plads, adgang til det fri og får økologisk foder. Der er også en mindre produktion af økologiske slagtekyllinger.
Forbruget af økologisk frugt og grønt stiger. En del af produktionen sker i Danmark, hvor der er økologisk produktion af frugt, bær, frilandsgrøntsager og grøntsager i væksthuse.
Siden 2005 har det været muligt at købe økologiske fisk fra ferskvandsdambrug og i 2010 blev det første danske havbrug omlagt til økologisk produktion.
Landbrug & Fødevarer udførte i 2016 i samarbejde med økologiske landmænd, Danmarks Kaninavlerforening, Hotel og Restaurantskolen i København og Restaurant Relæ et pilotprojektet om ”Økologisk Kaninavl”.